L'échoendoscopie est l'association de l'endoscopie et de l'échographie. Une sonde échographique est montée au bout d'un fibroscope ce qui permet d'examiner les structures au contact de la lumière digestive, par exemple la paroi du tube digestif, le pancréas, la voie biliaire principale, les ganglions péridigestifs.
Les sondes échographiques sont de fréquence élevée, ce qui donne une bonne résolution, mais interdit d'examiner plus loin que les quelques centimètres avoisinant le tube digestif.
L'échoendoscopie est une méthode coûteuse (environ 1 500 F) d'autant qu'elle est généralement réalisée sous anesthésie. Certains appareils permettent de faire une biopsie guidée par l'image échographique.
L'échoendoscopie est la meilleure méthode pour examiner la paroi du tube digestif supérieur ou du rectum. Dans le domaine hépatobiliaire, c'est l'examen de référence pour la détection de la lithiase cholédocienne (sensibilité supérieure à 95 %). Elle excelle également dans la détection de petites lésions pancréatiques ou ampullaires.
C'est un examen difficile, dont la qualité est grandement dépendante de l'expérience de l'opérateur. Comme l'endoscope est d'assez gros calibre et de maniabilité relativement réduite, des perforations digestives ont été parfois décrites. Enfin, ne pas oublier des complications de l'anesthésie.